がん治療は、手術療法、薬物療法、放射線療法を組み合わせることで進歩してきました。そして、がんと診断された早期から緩和医療を組み合わせることでがん患者さんのQOLが向上するとされています。そこで、がんの薬物療法、放射線療法、緩和医療の質的、量的向上を目的として、本院におけるがん診療に関係する諸部門を統括し効率のよい管理運営を実施するために、平成20年4月に、「化学療法部門」、「緩和医療部門」、「放射線治療部門」の3 部門より構成される、オンコロジーセンターが設立されました。
当センターは、がん患者さんの診療レベルの向上並びに腫瘍専門医（がん薬物療法専門医、放射線治療専門医、緩和医療専門医等）の育成にも多大な貢献を果たしてきました。当センターの機能をさらに充実させるために、平成27年9月にオンコロジーセンター棟が設立され、がん診療、臨床検査、化学療法、がん相談、遺伝カウンセリング、薬剤室、ゲノム検査など、がんに関する専門家による高度ながん医療の提供を目指しています。
令和２年度からはオンコロジーセンターは、新たに化学療法部門、小児部門、がん情報部門から構成されることとなりました。

【オンコロジーセンター棟】
1階：診察室（6診）、採血・検査室
2階：化学療法室１（21床）
3階：化学療法室２（21床）
4階：がん相談支援センター、AYAルーム、遺伝カウンセリング室、薬剤部
5階：キャンサーボードホール、がんゲノム医療センター/クリニカルシーケンスラボラトリ-ズ（平成29年度設置）